聖士提反堂中學第49屆畢業典禮已於2020年11月28日假聖士提反堂副堂舉行，謝子和主教親臨授憑及致訓。
陳婉玲校長在校務報告中簡述學校的發展概況。學校在兩年前已開始籌備BYOD，上學年在中二及中四級重點試行，因此即使在疫情下由面授課改為網課，師生亦很快適應過來。本學年BYOD計劃已推展至全校施行。
在STEM教育方面，學校實行「資優教育普及化」及「普及教育資優化」。施行方法包括在課程中加入scratch程式編寫、micro:bit實物編程及簡單電路的概念培訓。學校亦安排同學參加由水中銀主辦及皇家生物學會協辦的「生物科技大使計劃」，作為香港中文大學的夥伴學校，同學亦有幸參與「香港千足蟲的土壤生物多樣性」研究計劃。此外，在「中國．寧波紙飛機挑戰賽」中，三名同學打破全國紀錄，戴耀軒更獲得個人季軍殊榮。
學校關顧學生身心靈發展，舉辦「正向生命」分享會、「壓力是個好東西」講座及「禪繞畫」等活動，藉以培養同學的同理心及樂觀的思維，積極面對困難。受疫情影響，學校已申請把優質教育基金微型計劃延至本學年舉行。此外，學校十分重視生涯規劃教育，並加入「賽馬會鼓掌．創你程計劃」第二階段，成為會員學校。
謝子和主教致訓時回顧這充滿考驗而前路未明的不平凡的一年，他希望大家在疫情中反思及學習，變得更加堅強，而社會也更加團結，彼此守望相助。他又勉勵大家要肯定自己及懂得感恩。謝主教說我們都是上帝所愛的兒女，都是寶貴的，都有著上帝的恩賜，只是身邊的許多信息都讓我們覺得自己不夠好。他舉例簡單如擁有一雙美麗的手也可以是成為珠寶首飾模特兒的優厚條件。重要的是每個人都看到自己的恩賜及獨特性，願意發揮，有所貢獻，回饋社會。謝主教也強調感恩的重要性，「Count your blessings, not your problems 」及「Give thanks in all things」，哪怕最細微的東西也並非必然，如他的六叔就因為患上癌症而失去唾液。我們可以嘗試數算一天裏十件值得感恩的事情，可以用記事簿、手機把能令自己開心的小事記下來，即使面對困難、痛苦的時候，也總有值得感恩的事情。總之，要對自己、前路有信心，心懷感恩，心存盼望。
接著是校監致送長期服紀念品予教職員及畢業生致謝辭。最後，畢業典禮在謝主教的祝福中圓滿結束，給大家留下美好而難忘的回憶。
